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歪酷博客

It's better to burn out,than fade away.
laowang @ 2006-08-18 21:29

[自然要览] (选自英国Nature杂志,2006年8月17日出版) 封面故事:影响核小体定位的因素 A genomic code for nucleosome positioning 真核基因组在活体中不以裸露DNA形式存在,但在被称为染色质的蛋白-DNA复合 物中是以裸露DNA形式存在的。染色质含有核小体,它们是紧紧包裹在一个组蛋 白核心周围的短DNA片段,排斥大多数结合DNA的蛋白,所以起抑制剂的作用。在 一项研究工作中,研究人员将计算方法和实验方法结合起来,用以确定核小体对 DNA序列的偏好,并预测整个基因组范围内核小体的组织。酵母基因组编码一个 内在的核小体组织,这可以解释活体中核小体位置的大约一半。该编码在不同真 核细胞中都高度保留了下来,它的作用是将转录因子引导到它们的结合点,并辅 助很多其他的特定染色体功能。本期一篇配发的News and Views文章讨论了DNA 序列和其他调控因子在核小体定位中所起的作用。(Article p. 772; News and Views)封面图片(绘图:Helit Sayfan Altman)所示为带有几个核小体的一段 染色质。 禽流感在家禽中的“静静传播”(Bird flu) Silent spread of H5N1 in vaccinated poultry 有人认为,H5N 禽流感病毒的“静静的传播”可能曾在越南和其他地方的家禽和 野生鸟类中出现,后者感染了不会诱发疾病症状的H5N1抗原变种。这一观点使人 们担心,通过接种让家禽对H5N1病毒产生免疫力,有可能同样会增加发现疫情之 前家禽内的交叉传播。一项数值模拟研究表明,这种担心是很有道理的:由于在 禽群水平上保护措施不全面,“静静的传播”有可能在一个进行了接种预防的禽 群中出现,即便疫苗对禽群中的个体是有效的。这一问题的部分解决办法是,采 用未进行接种预防的“哨兵”。(Brief Communications p. 757) 多铁材料和磁电耦合(The best of both worlds) Multiferroic and magnetoelectric materials 关于多铁和磁电材料的研究正在重新兴起。多铁材料将铁电晶体稳定的、可切换 的电极化与通过铁磁晶体的量子力学交换现象产生的稳定的、可切换的磁化结合 了起来。真正的“多铁”材料几乎不存在,而磁性和电性的“磁电耦合”更为普 遍。由于这种材料有技术应用前景,所以属于这种类型的一些引人注目的新化合 物正在开发当中。(Review Article p. 759) 设计通用量子逻辑门已万事俱备(Spin qubits ready to roll) Driven coherent oscillations of a single electron spin in a quantum dot 实现现实的量子位的最有希望的方法之一是,利用半导体量子点中的单电子自旋 状态。关于这种自旋量子位的一个详细技术建议是在大约10年前发表的,此后, 实现这种自旋量子位所需的全部要素(如长寿命自旋态和电子自旋的初始化)已 被一一报道出来。现在,最后一步,也是最难的一步也已经完成,那就是驱动单 个电子的相干自旋振荡,这是完成量子运算所必需的。这一点是通过施加振荡磁 场做到的,这种磁场与电子自旋的进动频率发生共振,是在一个双量子点系统附 近的芯片上产生的。现在,设计通用量子逻辑门的一切条件都已具备。 (Article p. 766, News and Views) PML作为药物作用目标的双重身份(Double target) PML inhibits HIF-1 translation and neoangiogenesis through repression of mTOR 肿瘤抑制因子PML已知是肿瘤中和正在从缺血状态恢复的组织中血管形成的一个 关键抑制因子。PML的失去与各种不同的人类癌症有关,包括乳腺癌和前列腺肿 瘤。它在控制血管生成中所起的作用,使其成为癌症中的一个药物作用目标(在 癌症中,提高其含量是药物治疗的目标),也使其成为在缺血性心脏病或中风后 鼓励新的血管形成的一个药物作用目标(在这种情况下,可以通过降低其含量来 鼓励新的血管形成)。(Article p. 779) 星系形成过程中一个关键时期的事件观测 (An epoch-making galaxy) The rapid formation of a large rotating disk galaxy three billion years after the Big Bang 配备有最新近红外成像分光镜和适应性光学系统的大型陆基望远镜,能够观测发 生在星系形成一个关键时期(“大爆炸”之后约30亿年,当时宇宙只有其现在年 龄的约20%)所发生的事件。对这一时期一个正在形成恒星的高红移(z=2.38) 星系所做的观测显示了该星系的内部结构。一个巨大的、转动的原始盘,在将气 体送往位于中心位置的一个由恒星鼓出的包中的一个正在不断增长的黑洞中。以 前,星系的分级积累中所涉及的时间尺度和过程只是一种猜测;现在,它们是所 观测到的东西。而且,随着这一时期更多星系得到分析,关于星系形成的模型还 可以进一步优化。(Letter p. 786; News and Views) 火星上的冰盖(A levitating ice cap) No signature of clear CO2 ice from the 'cryptic' regions in Mars' south seasonal polar cap / CO2 jets formed by sublimation beneath translucent slab ice in Mars' seasonal south polar ice cap 本期两篇论文讨论了在火星南方所看到的引人注目的季节变化。火星上的冰盖主 要由冷冻的二氧化碳组成,冰盖上有不寻常的暗点,它们被认为是由一块透明 的、近乎纯净的CO2冰形成的。Langevin等人提供了来自搭载在“火星奥德赛” 上的THEMIS照相机所拍摄的红外和可见光图像,它们与火星上存在一块很厚的透 明冰的观点是不一致的。在与该论文相伴的一篇论文中,Kieffer等人报告了他 们的红外和可见光数据,这些数据表明,所观测到的景观在入夏很久之后也能保 持在CO2冰的温度下,而且它们一定是被带到冰表面上的颗粒物质。他们提出了 一个模型,按照该模型,存在一种半透明的、不能渗透的CO2冰盖,在该冰盖的 底部会出现升华现象,产生在冰下流动的高速CO2气体流,使冰盖升起,同时产 生能将沙子大小的颗粒通过喷孔喷出去的喷射流。(Letters pp. 790, 793) Skyrmion的其他存在形式(The march of the skyrmions) Spontaneous skyrmion ground states in magnetic metals 现代物理学中一个长期存疑的问题,是按照连续场中可数粒子对“波-粒二象 性”进行描述。我们知道,被称为skyrmion的像粒子一样的状态(这些状态是由 Tony Skyrme设想出来的)是从微观尺度到宇宙尺度的非线性场模型的一个特 点。但迄今为止,我们只确定了skyrmion以激发态存在;当它们被外部场或拓扑 缺陷稳定时,以图灵模式存在;在量子霍尔磁体中以自旋图案存在;或在液晶中 以蓝相存在。新的理论工作表明,skyrmion还能在不同类型磁性金属中形成稳定 的基态,处于这种状态时它们应能够用现代磁性显微镜方法直接观测到。按照这 一新理论,skyrmion基态应普遍存在于大量材料中。(Letter p. 797) 古生菌在土壤氨的氧化中居主导地位(Soil bacteria yield to archaea) Archaea predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in soils 硝化作用指的是微生物将氨转换成硝酸盐的过程,它是全球氮循环中的一个关键 过程。人们曾经普遍假设,专门进行硝化作用的细菌是土壤中在需氧条件下氧化 氨的主要细菌。对为名叫“氨单氧酶”的关键酶的一个亚单元编码的amoA基因的 丰度所做的分析表明,在来自三个不同气候带的12种不同土壤类型中,来自泉古 菌门(Crenarchaeota)的古生菌的amoA基因数量要比细菌的amoA基因数量多3000 倍。所以,在原始土壤和农业土壤中,古生菌迄今似乎都是居主导地位的氨氧化 剂。(Letter p. 806) 用于物体识别的新算法(Seeing things) Hierarchy and adaptivity in segmenting visual scenes 即便是在吵杂的视觉图像中,人类通常也能够毫不费力地找到相干区域,这是物 体识别的关键。在自然观看条件下,电脑算法在完成这项任务时一直不是很成 功,部分原因是,早期关于该问题的研究工作只对图像进行了局部计算。现在, 一种新方法已经开发出来,它所靠的是图像分割,即对一个图像的所有突出区域 进行分析,再将这些区域做成一个有层次的结构。该方法比以前的方法更快,更 准确,但所得到的算法使用起来相对比较简单。研究人员通过在由物体构成的一 个大数据库中寻找与一个目标物体相匹配的物体的方式,对这种新方法进行了演 示。(Letter p. 810) 癌症干细胞的身份(Identity of cancer stem cells) Transformation from committed progenitor to leukaemia stem cell initiated by MLL–AF9 癌症被认为是来自正常组织细胞或定向祖细胞。关键问题是,在后一种情况下, 能够自行更新(祖细胞缺乏这种能力)的癌症干细胞是怎样出现的。有一组小鼠 白血病干细胞,将少到只有4个的这种细胞注射进小鼠体内,就能诱发白血病。 现在,这样的小鼠白血病干细胞已经从通过定向祖细胞中的一个突变患上白血病 的小鼠身上分离出来。这使得研究人员有可能利用基因表达筛选的方法来确定这 些细胞的共同身份,观察从正常祖细胞向白血病干细胞的转变。 引人注目的 是,白血病干细胞大体上能够保持定向祖细胞的基因表达特点,同时激发正常情 况下在造血干细胞中表达的一个亚组的基因。至少可以说,这些基因中有些对于 白血病干细胞的自行更新是重要的。白血病干细胞和正常干细胞之间的差别,对 于开发一种能够选择性地以癌症干细胞为目标的药物的工作来说也许还是好消 息。(Letter p. 818; News and Views) Notch受体在控制干细胞的一个通道中所起的作用(Stem cells go up a Notch) Notch signalling regulates stem cell numbers in vitro and in vivo 将干细胞用于治疗的一个障碍是,难以控制它们的生长和分化。 Androutsellis-Theotokis等人发现,Notch受体在控制胚胎干细胞、胎儿干细胞 和成年干细胞的一个通道中扮演一个至关重要的角色,而且向成年大鼠的大脑中 施用Notch配体,可帮助大鼠在一次模拟中风之后恢复行动。该发现为以鼓励身 体内生的干细胞去修复损伤、而不是试图生长和移植新细胞为目的的疗法铺平了 道路。(Letter p. 823) 丙肝病毒的NS2自身蛋白酶的晶体结构(Hepatitis C) Structure of the catalytic domain of the hepatitis C virus NS2-3 protease 全世界超过1.5亿人感染了丙肝病毒,没有针对该病毒的疫苗,目前的治疗方法 只对有限的患者人群有效。 所以,更有效的抗病毒疗法是人们迫切盼望的。因 此,关于丙肝病毒的NS2自身蛋白酶的晶体结构的报告是一项重大进展。该结构 显示,NS2是一种二聚的半胱氨酸蛋白酶。该结构将有助于说明NS2在病毒生命周 期中所起的作用,并且还可能有助于新药设计。(Letter p. 831)


 
laowang @ 2006-08-11 22:54

[自然要览] (选自英国Nature杂志,2006年8月10日出版) 封面故事:5亿年前的动物胚胎化石? Synchrotron X-ray tomographic microscopy of fossil embryos 保存非常好的、距今已有5亿年的动物胚胎化石(里面嵌入了磷酸钙,外面也包 裹了一层磷酸钙)引起人们很大兴趣,因为它们可能含有关于动物演化一个关键 阶段的发育过程的宝贵信息。 这些化石尺寸很小,这使得人们难以对它们进行 研究,但一种新开发的方法可以让科学家恢复以前无法接触到的结构细节。这种 新方法要用到利用一个同步加速器X-射线光源进行亚微米尺度的断层分析,它被 用来解决化石形成过程中的一些极端问题。关于已知最早的两侧对称动物胚胎 Markuelia 和 Pseudooides的微型化石的内部解剖结构的引人注目的数据,澄清 了关于前者发展史的某些疑问,并且显示了关于后者发育过程的一个以前未知的 模型。本期封面所示为一个Markuelia胚胎的一系列虚拟切片,它们既显示了这 种动物的胚胎特征,也显示了其死后特征。(Letter p. 680) 小鼠鼻子中的第二套嗅觉受体(Make scents of pheromones) A second class of chemosensory receptors in the olfactory epithelium 研究人员在小鼠鼻子中发现了第二套嗅觉受体,其中包括一些可能探测信息素、 因而也许与交配有关的嗅觉受体。这些受体的基因也存在于鱼类和人类中,这让 我们看到这样一个可能性:一种人类信息素受体可能很快将被发现。新发现的与 痕量胺相关的受体(TAAR)存在于鼻腔内层中一组独特的细胞表面上,与探测气 味的受体分子明显不同。 至少有三种不同的TAAR识别小鼠尿液中的不同化合 物,这说明它们在探测个体间微妙的化学信息中可能扮演一个角色。(Article p. 645; News and Views) Card9蛋白与先天免疫性的关系(A new line in immunity) Card9 controls a non-TLR signalling pathway for innate anti-fungal immunity 我们很不了解的Card9蛋白(在结构上与先天免疫系统中所涉及的Carma蛋白相 关)存在于包括血液淋巴细胞和脾脏在内的各种不同组织中。现在,Card9被发 现控制一种以前不知道的、具有抗菌活性的先天免疫通道。Card9与Dectin-1发 生相互作用,后者是哺乳动物先天免疫系统探测真菌的主要模式识别受体。该结 果表明,先天和适应性免疫系统在演化上截然不同的ITAM受体,都通过对上游适 应子的不同使用来选择性地结合保留下来的Bcl10/Malt1信号作用模块。 (Article p. 651) 关于古老恒星中锂数量的矛盾被解决(Cosmic lithium: out of sight) A probable stellar solution to the cosmological lithium discrepancy 对宇宙微波背景所做的精确测量,揭示了关于早期宇宙的性质及其膨胀过程的很 多信息。然而,有一个长期未能解决的矛盾:在最古老恒星上所观测到的锂的量 不到“大爆炸”中的核反应所产生的锂的一半。现在,Korn等人解决了这一矛 盾。他们发现,其他元素的丰度变化趋势可由扩散性涡动混合过程来解释,这个 过程将锂带到了恒星深层。(Letter p. 657; News and Views) 直径小于100米的海王星外天体(Solar System minnows) Occultation of X-rays from Scorpius X-1 by small trans-neptunian objects Scorpius X-1 (Sco X1)在天文学历史中具有重要地位,因为它曾经是 除太阳以 外第一个所探测到的宇宙X-射线源。现在,它有了一个新头衔:由“Rossi X-射 线定时探测器”卫星所获得的关于该天体X-射线光曲线中小而显著的下降,可能 代表着首次观测到的小型(直径小于100米)海王星外天体(TNO)。这些不规则 性出现在毫秒尺度上,几乎可以肯定是由微型TNO的隐藏造成的。自从奎波带天 体首次于1992年被发现以来, 迄今已经发现了超过1000个TNO。已经观测到的 TNO 直径在数百公里至几千公里之间,但预计还存在很多更小的天体。(Letter p. 660; News and Views) 声子-偏振子波及相关X-射线衍射技术(Many ions make light work) Tracking the motion of charges in a terahertz light field by femtosecond X-ray diffraction 通过空气传播的光的基本粒子是光子。但当光通过凝聚态物质传播时,它会与凝 聚态物质的晶格产生耦合,生成复杂的粒子,被称为偏振子。一项新的研究工 作,利用超快X-射线衍射来直接观测支持固体中这种光激发的原子位移。在这项 研究中,穿过铁电性钽酸锂(LiTaO3)传播的太赫辐射与晶格振动产生耦合,生 成声子-偏振子波。这种新的X-射线衍射技术使研究人员有可能去跟踪晶格中支 持这种波的传播的离子的绝对位移。(Letter p. 664) 火山岩浆从地幔流出的机制(Magma goes up in the world) The dynamics of melt and shear localization in partially molten aggregates 沿地球构造边界分布的火山的岩浆,是来自深层地幔中所产生的熔融物,但这些 熔融物是怎样从地幔到达火山的却仍然不清楚。受到最近一些发现部分熔融的岩 石中存在由应力驱动的分离现象的实验工作的启发,Katz等人提出了一个新理 论,来解释这一系统的行为。该理论预测,在正在发生变形的、部分熔融的团块 中,会自然出现成带状分布的集中的熔融物和剪切力。这说明,熔融的岩石从海 洋中部山脊下面的地幔中的快速流出,可能是通过一个具有高度渗透性的、由富 含熔融物的带状结构结成的网络发生的,而不是通过慢速流动的、统一分布的多 孔流发生的。(Letter p. 676) “刺胞动物”与两侧对称动物的Hox基因(Dividing line for Hox genes) Minimal ProtoHox cluster inferred from bilaterian and cnidarian Hox complements 从昆虫到人类的两侧对称动物的身体主轴,是在名为Hox的同一组基因的指示下 形成的。了解Hox基因的演化及相关的ParaHox基因,需要关于在更为古老的动物 类别中的Hox基因的互补基因的知识。Chourrout等人研究了这样两种动物中的 Hox基因,它们分别是“刺胞动物”Nematstella 和 Hydra, 是在距今6亿年前 出现的。虽然这些生物具有与两侧对称动物的前部Hox基因群相应的基因,但这 些Hox基因的其余部分却有独立起源的迹象。该研究还表明,假设中的ProtoHox 祖先基因群有一个简单的起源,即起源于仅仅两个基因。经过广泛的基因复制 后,“刺胞动物”和两侧对称动物的Hox基因群遵从了独立的演化轨迹,得到了 不同的结局。(Letter p. 684) IT皮质中的神经活动与物体识别相关(Making faces) Microstimulation of inferotemporal cortex influences face categorization 在灵长类动物大脑皮层中一个被称为下颞叶皮质(IT)的区域所进行的直接电生理 记录和fMRI扫描实验表明,该区域选择性地对高度复杂的视觉刺激(如面部特 征)做出响应,从而导致这样一个假设:大脑中这个区域与物体识别有关。现 在,研究人员获得了该假设的直接证据,因为他们发现了面部选择神经元与面部 识别之间的一个直接联系。 IT皮质中面部选择神经元的微弱电刺激,会导致猴 子关于面部类别的决定发生一个严重偏差。除了将 IT皮质中的神经活动与物体 识别联系起来外,这项研究工作还为今后进行关于物体形状的神经编码的研究搭 建了舞台。(Letter p. 692; News and Views) 可提高水稻抗涝性能的基因(Not taken at the flood) Sub1A is an ethylene-response-factor-like gene that confers submergence tolerance to rice 在很多亚洲国家,由于洪水损毁水稻作物而导致巨大的经济损失。大多数水稻栽 培品种会在完全浸在水中后一周内死亡,但也有一些品种能在水下生存几个星期 时间,这是由于它们有一个较大的定量特性基因位点,被称为Submergence 1 (Sub1),其位置在第9号染色体的着丝点附近。现在,对 Sub1基因所做的一项详 细研究发现,其中的一个基因Sub1A是水稻抗浸没性能的主要决定因子。将Sub1A 引入一种在亚洲广泛栽培的水稻品种中,可提高其在洪水条件下的存活率,而不 需要以牺牲其高产量和其他优点为代价。(Letter p. 705; News and Views)


 
laowang @ 2006-08-07 23:57

[自然要览] (选自英国Nature杂志,2006年8月3日出版) 封面故事:一种新型智能液体微型镜头 Adaptive liquid microlenses activated by stimuli-responsive hydrogels 光学成像、医学诊断和“建在一个芯片上的实验室”技术等领域的微型化趋势, 正在为尖端微型镜头创造出一种市场需求。现在,研究人员研制出了一种新型智 能液体微型镜头,它与目前的大多数镜头的不同之处在于,它能自对焦。这种镜 头的关键部件是一种能对刺激产生响应的水溶胶,该水溶胶被集成进一个微型液 体系统中,充当一个液滴的容器。该水溶胶同时探测刺激和促使液滴形状发生变 化,从而也使焦距发生变化。刺激包括生物和化学试剂以及物理参数。在这种微 米尺度上,固定的液-液界面被用来获得稳定的装置,从而实现10秒到几十秒的 响应时间。这样的镜头可以具有几乎任意长度的焦距,并且可以方便地集成进阵 列中。本期封面所示为一种智能液体微型镜头,在其中,一种水溶胶(图中带斑 纹的环)根据一个局部刺激调控镜头形状。(Letter p. 551) 花卉温度对昆虫的吸引力(A warm reception) Behavioural ecology: Bees associate warmth with floral colour 颜色鲜艳的花对授粉的昆虫是有吸引力的,昆虫在飞到这些花上时,会预料到能 获得一种营养回报,如花蜜。但昆虫在选择一种花而不是另一种花时,它们所要 寻找的可能并不只是食物。它们利用大量能量使其体温保持在高于环境温度的水 平上,有些花能提供温暖,用颜色来彰显自己的存在。在一个受控的实验中,大 黄蜂喜欢造访较温暖的花,它们在降落之前利用颜色来预测花的温度。这一发现 对于研究花卉结构的演化可能具有参考价值。(Brief Communication p. 525) P2X受体的重要性(ATP the outsider) P2X receptors as cell-surface ATP sensors in health and disease ATP是所有活细胞中能量交换的通用货币,但它也存在于细胞外,与跨膜受体发 生相互作用,来影响神经细胞、肌肉、腺体和免疫细胞中的细胞内事件。在从细 胞中释放出来时,ATP可激活P2X受体,该受体是存在于大多数身体组织中的非选 择性阳离子通道。由于没有药理学方面的工具,科学家对这些受体所发挥的生理 作用很不了解。但现在有了“苏拉明”(suramin) 和PPADS这样的P2X阻断药物, 这些受体作为细胞表面ATP传感器在健康和疾病中的重要性正在被人们所认识。 (Review Article p. 527) 一些基因对胚胎干细胞分异的影响(A genetic sketch of stem cells) Dissecting self-renewal in stem cells with RNA interference 在一项大规模基因组学研究中,研究人员确定了大量候选基因对细胞分异的调控 作用的贡献。短发卡RNA(shRNA)基因沉寂作用被用来逐个沉寂65个基因的表 达,这些基因的表达水平在小鼠胚胎干细胞分异时是下降的。将这些基因中的7 个删除,会对自我更新产生负面影响。这些分子在使胚胎干细胞具有自我更新的 能力和生成很多其他细胞类型的潜力方面可能发挥着重要作用。(Article p. 533) 通过数值模拟解决标准宇宙模型与观测结果的矛盾(A cosmological paradox) The removal of cusps from galaxy centres by stellar feedback in the early Universe 虽然标准宇宙模型能够成功描述宇宙的大尺度结构,但在较小的尺度上该模型却 不是很好。例如,该模型所预测的附近星系中心暗物质密度(密度曲线中的一个 尖峰或低谷)要比实际观测中所看到的低,这说明星际暗物质晕圈有一个“平 坦”的中心核。Mashchenko等人通过数值模拟解决了这个矛盾。他们的数值模拟 表明,小型原始星系中由以超新星形式出现的恒星反馈作用所驱动的气体的随机 体量运动,有可能使中央暗物质尖峰变平。当这种尖峰被除掉后,在随后的星系 合并过程中将不能再产生,所以在当前的宇宙中,小星系和大星系都会有平坦的 暗物质核心密度曲线。(Letter p. 539) 不会被吞噬的伴星(In the shadow of a giant) Survival of a brown dwarf after engulfment by a red giant star 在像我们的太阳一样的恒星周围的轨道中,已经发现了超过100颗行星和褐矮 星。当这些恒星演变成为红色巨型星时,它们将会轻易吞噬其伴星,而这之后会 发生什么呢?一颗白矮星的第一颗已知的近距离亚恒星(褐矮星)伴星的发现表 明,让我们意想不到的是,这些伴星中有些会在相互作用中存活下来,相对保持 不变。(Letter p. 543; News and Views) 太阳辐射对有机质分解的重要影响(Sunlight drives decay) Plant litter decomposition in a semi-arid ecosystem controlled by photodegradation 生物过程被认为是陆地生态系统中有机质分解的主要原因,而由UV-B辐射所引起 的降解等非生物过程扮演次要角色。但根据在半干旱的巴塔哥尼亚荒原上所进行 的一项研究,事实不是这样的。在这里, 研究发现,影响碳的周转的主要因素 是太阳辐射。阻断全部阳光或UV-B,会大大降低树叶杂草等的分解速度,而土壤 有机物的减少或限制性土壤资源的增加却没有影响。这些结果表明,碳循环有一 个短的周期,初级生产的相当大一部分可能会通过光降解丢失到大气中,而不通 过土壤有机质库进行循环。由于地球陆地表面近40%是沙漠,所以影响辐射水平 的全球变化因素(如臭氧损耗或云层)有可能对碳的存储产生很大影响。 (Letter p. 555) 30亿年前就存在消减过程(Early signs of plate tectonics) Record of mid-Archaean subduction from metamorphism in the Barberton terrain, South Africa Nature杂志上7月13号的一篇News Feature文章透露了关于板块构造“年龄”的 一场争论。板块构造塑造了我们今天所看到的世界,但关于它是什么时候开始的 问题却是一个让地质学家仁者见仁、智者见智的问题。在本期Nature上,Moyen 等人非常可信地论证了在30亿年前就存在消减过程(板块构造的一个关键部 分),而在那时板块构造本身是否存在就曾受到质疑。他们在论证中所依靠的证 据,来自32亿年前一个“太古代”山系(南非的Barberton绿岩带)中高压、低 温变形的标记。这一结果是科学家首次明确指出在“太古代”中期存在这种类型 的活动。(Letter p. 559) 钙调蛋白的水平与鸟喙长度相关(The long and the short of it) The calmodulin pathway and evolution of elongated beak morphology in Darwin's finches 几年前,“达尔文雀类”(指在教科书中始终与自然选择的适应辐射联系在一起 的鸟类)不同物种的喙的深度和厚度被发现与Bmp4 (骨形态遗传蛋白-4)的表达 相关。当时,一次寻找候选目标的筛选工作并没有发现任何有可能与不同喙长度 有关的基因。现在,对不同“达尔文雀类”胚胎的喙原基中的转录情况所做的 DNA微阵列分析表明,钙调蛋白(一种参与Ca2+信号作用的分子)的水平与喙长 度相关。有了这两个调控喙生长不同尺度的通道,就可以设想出一个能够在不同 选择条件下生成很多不同喙结构的机制来,从而也能选择出一个比较好的关于适 应辐射的模型来。(Letter p. 563; News and Views) 面部识别的机制(An eye for a face) Norm-based face encoding by single neurons in the monkey inferotemporal cortex 30年以前,研究人员在猴子的下颞叶皮层中发现了面部选择神经元。尽管此后有 数十项关于这种“面部细胞”的报道,而且人们还普遍假设这样的神经元很可能 参与面部识别,但此后人们几乎没有对尖峰响应与关于人类面部感觉的大量心理 物理文献进行对比。但现在,一组新的实验结果将猴子下颞叶皮层中的面部选择 神经元与关于面部感觉的一个明确的心理层面联系了起来。在该研究中,研究人 员对短尾猴进行训练,让其识别由电脑生成的人脸。结果表明,参加实验的猴子 是通过将电脑生成的一个人脸与其大脑中存储的一个一般的或“标准”的人脸进 行对比来识别的,而不是通过记忆每个人脸是什么样子来进行识别的。人类中的 一个类似的机制也许可解释我们为什么能够在不到一秒的时间内识别出一个面孔 来。(Letter p. 572) 能激活Merlin肿瘤抑制因子的磷酸酶(Tumour-causing cascade) Tumorigenic transformation by CPI-17 through inhibition of a merlin phosphatase 研究人员已经识别出了激活Merlin肿瘤抑制因子(也被称为神经纤维瘤-2)的磷 酸酶。它是一种肌浆球蛋白磷酸酶,被内生抑制因子CPI-17所抑制,后者的水平 在人类肿瘤中经常是升高的,可能通过使Merlin失去活性而有助于癌症的形成。 将这些发现放到一起,我们就会看到一个新的肿瘤抑制级联过程,该过程可通过 至少两种方法被破坏:通过突变(NF2),或通过升高假定的新致癌基因CPI-17 的水平。(Letter p. 576) 描述锯蛋白分异的分析模型(Prions divide then rule) The physical basis of how prion conformations determine strain phenotypes 相同锯蛋白微粒能在活体中产生不同表现型或不同“类别”。这个矛盾通常是用 锯蛋白构型的差异来解释的。Tanaka等人提出了一个分析模型,该模型描述了酵 母中锯蛋白不同物理参数与锯蛋白微粒之间的相互影响何以导致一种特定类型的 锯蛋白的出现。他们的实验显示,最强的表现型事实上是通过一个生长缓慢而脆 性增加(脆性增加会促使锯蛋白分裂)的微粒生成的。 锯蛋白微粒进行分裂、 为进一步生长生成新的“种子”的趋势,在感染性(锯蛋白)和非感染性淀粉质 对其寄主的重大生理影响中可能是一个关键因素。(Letter p. 585)


 
laowang @ 2006-08-06 22:57

EB是诱变剂,有累积效应,不要直接接触,但是要注意通过呼吸摄入,故此环境要通风。 EB可以被皮肤吸收。做实验的时候一定要带手套。它是DNA突变的诱变剂,可以嵌入DNA,使DNA发生突变,致癌。 但是,只要按照标准的操作使不会有问题的。 1 严禁随便丢弃。因为EB是强致癌性,而且易挥发,挥发至空气中,危害很大。 2 废 EB溶液的处理方法 (1) 对于EB含量大于0.5mg/ml的溶液,可如下处理: a. 将EB溶液用水稀释至浓度低于0.5mg/ml; b. 加入一倍体积的0.5mol/L KMnO4 ,混匀,再加入等量的25mol/L HCl,混匀,置室温数小时; c. 加入一倍体积的2.5mol/L NaOH,混匀并废弃。 (2) EB含量小于0.5mg/ml的溶液可如下处理: a. 按1mg/ml的量加入活性炭,不时轻摇混匀,室温放置1小时; b. 用滤纸过滤并将活性碳与滤纸密封后丢弃。 3 废EB接触物,如抹布,枪头。 一般回收至黑色的玻璃瓶中,定期进行焚烧处理。 由于EB是一种诱变剂,直接倒入水槽或扔进拉圾箱可能会带来危害。所以应该根据情况处理: 1. 电泳胶 胶里面痕量的EB没有问题,如果小于0.1%可以直接扔掉。而如果发红,即大于等于0.1%时应该放在生物危害柜中焚烧掉。 2. EB溶液 <10ug/ml 时可以直接倒入水槽 >10ug/ml 时应该用木炭过滤或化学方法使其失活(推荐用木炭过滤的方法) 溶液中还有重金属、氢化物、硫化物时应该按照危险垃圾处理 化学中和方法: 方法一:加等体积的漂白粉,搅拌4小时,静置4天,用NaOH调至pH4-9, 倒入排水沟的同时用大量水冲。 方法二:每100ml加5%磷酸,加12ml0.5M的NaNO3,搅拌并静置20小时,同上调pH, 倾倒。 3. 手套、设备等物品 放在医用垃圾中焚烧,如污染严重则用漂白剂处理。 EB的净化处理方法 小心:溴化乙锭是强诱变剂,并有中度毒性。取用含有这一燃料的溶液时务必戴上手套。这些溶液使用后应按下面介绍的方法之一进行净化处理。 (一)溴化乙锭浓溶液(即浓度>0.5mg/ml 的溴化乙锭溶液)的净化处理 方法Ⅰ: 用沙门氏菌——微粒体测定法表明。本方法可使EB的诱变活性降至原来的1/200 左右。 1)加入足量的水使EB的浓度降低至0.5mg/ml以下: 2)在所得的溶液中加入0.2体积的新配制的5%次磷酸和0.12体积的新鲜配置的0.5mol/L亚硝酸钠,小心混匀。切记:检测该溶液的pH值应<3.0,市售次磷酸一般为50%溶液,具有腐蚀性。应小心操作。必须在临用前现用现稀释。亚硝酸钠溶液(0.5mol/L)的配法:用水溶液34.5g亚硝酸钠并定容至终体积500ml,现用现配。 3)于室温温育24小时后,加入大大过量的1mol/L碳酸钠。该溶液可予丢弃。 方法Ⅱ: 用沙门氏菌——微粒体测定法检查,经用本方法处理后,可使EB的诱变活性降低至原来的1/3000左右。但也有报告称,在用净化溶液处理的空白样品中,偶尔有一些仍具有诱变活性。 1)加入足量的水使EB的浓度降低至0.5mg/L以下; 2)加入1倍体积的0.5mol/L KMnO4,小心混合后再加入1倍体积的2.5mol/L HCl小心混匀,于室温放置数小时; 3)加入1倍体积的2.5mol/L NaOH小心混合后可丢弃该溶液。 (二)EB稀溶液(如含有0.5ug/ml EB的电泳缓冲液)的净化处理 方法Ⅰ 1)每100ml溶液中加入2.9g Amberlite XAD-16,这是一种非离子型多聚吸附剂,可向Rohm & Haas公司购置; 2)于室温放置12小时,不时摇动; 3)用 Whatman 1号滤纸过滤溶液,丢弃滤液; 4)用塑料袋封装滤纸和Amberlite 树脂,作为有害废物予以丢弃; 方法Ⅱ 1)每100ml溶液中加100mg粉状活性炭; 2)于室温放置1小时,不时摇动; 3)用Whatman 1 号滤纸过滤溶液,丢弃滤液; 4)用塑料袋封装滤纸和活性炭; 注:用次氯酸(漂白剂)处理EB稀释液并不可取; EB在262℃分解,在标准条件进行焚化后不可能再有危害性; Amberlite XAD-16 或活性炭可用于净化被EB污染的物体表面


 
laowang @ 2006-08-06 22:54

本来有好多东西要写的,可现在又什么都不想写了,所以不写了,所以,从今天开始,我的blog走学术路线!


 
laowang @ 2006-06-22 23:29

没有考试的日子就是放假吧,不过多少有一点无聊,人就是不知足,放假了,无聊怎么了,还要怎么样,放假就要好好享受生活,不放假也是要享受的,享受寂寞。世界杯还在继续,我的生活还在继续。


 
laowang @ 2006-06-21 23:41

万恶的考试今天结束了,等着小学期,然后大四。又是一年毕业时,可是今年的合欢花还没有开。明年就轮到自己了,每年的这个时候心里都很乱的,很伤感,很复杂的感觉。初中、高中毕业时的场景依然历历在目。把好朋友们一个个送上远去求学的列车,约好再相见,约好“苟富贵,毋相忘”,这么多年过去了,物是人非,只有分离是永恒的,曾经的誓言谎言,曾经的欢笑泪水都烟消云散了。还有谁会偶尔想起我,我还会偶尔想起谁呢?


 
laowang @ 2006-06-10 23:59

借着世界杯,一口气写了好多篇BLOG,都是有关最近读的书的,其实也有一段时间了,最近在忙着考试,毕竟期末了。也会关注世界杯,毕竟四年一届 ,可是自己的激情似乎并不是太高,我是不会熬夜看球的,不过,球还是要看的。谁会夺冠呢,巴西?德国?......希望德国赢吧,虽然也看好巴西,喜欢德国的风格,也许还有其他原因吧,对德国是一种怎样的感情呢?也许足球以外的原因更多一些吧。


 
laowang @ 2006-06-10 23:50

久闻其名的书,这次其实完全被封面吸引。弗拉基米尔·纳博科夫(Vladimir Nabokov,1899-1977)最有名的作品,曾受到争议。读过之后感觉好累,不作评论了,闲下来有必要再认真读一下的。


 
laowang @ 2006-06-10 23:40

杜拉斯代表作之一,自传性质的小说,获一九八四年法国龚古尔文学奖。全书以法国殖民者在越南的生活为背景,描写贫穷的法国女孩与富有的中国少爷之间深沉而无望的爱情。万圣买到的上海译文出版社王道乾译的版本,很喜欢封面的设计,简约的风格,淡淡的绿色。“我认识你,永远记得你。那时候,你还很年轻,人人都说你美。现在,我特来告诉你,对我来说,我觉得现在你比过去更美。相比你年轻的容貌,我更爱你现在备受摧残的面容。”——《情人》。时间是一剂良药,可以抚平伤疤。然而伤痕永远的留在心底。我们在生命间行走,遇见一些人,彼此相爱,然后又彼此分离。用了很长的一段时间去遗忘对方,然后一切归于平静。却在很久很久以后,发现掩埋在心底的痕迹。爱情不能够永远。分离可以。 永远的分离,在杜拉斯的笔下,华丽而寂寞。还有什么可以永远呢?


 
laowang @ 2006-06-10 23:28

第一次看安妮宝贝的书,以前是不屑,一个偶然的机会读到了《莲花》。有关就赎的书,读过有淡淡的伤感。这本小说,后现代主义风格,神秘清冷的气质,笔调优美抒情,揉合寓意和哲理,厚重壮阔。既有细节敏感的文字描写,又有对人性的深入反映和探索,表达了中国当前城市人群的情感和内心,以及他们所困惑的对于爱,信仰和生命本质的追寻和探询。这是一本以真实地点为背景的长篇小说。既是小说,说明它完全来源于虚构。因为虚构,地点产生新的暗示。仿佛所写的此地,另有他方。它和真实的关系变得微妙。涉水而过,投奔岸的另一边。小说叙述年轻女子庆昭身患疾病,滞留高原,静等死亡。中年男人善生刚刚结束追名逐利的暄腾往日,内心长久压抑的黑暗苏醒,准备去与世隔绝的墨脱,寻访旧友内河。内河是被世界遗忘的女子,命运多舛。一路上善生向庆昭讲述自己和内河的往昔,雅鲁藏布江江河谷的奇崛险阻,恰似叙述中依次展开的一代人苦痛而流离的蜕变过程......


 
laowang @ 2006-05-31 23:34

今天,端午节;明天,儿童节。喜迎双节到来。有装嫩的嫌疑吧,对儿童节是很期待的,不知有没有过儿童节的年龄限制,反正自己是想一直过下去的,以后和儿子一起过。希望自己可以永远以一颗童心坦然面对生活。中午吃了两个粽子,像米饭一样,毕竟,是端午节,纪念一下屈爷爷。最近,突如其来冒出好多考试,一切都会过去的。